故事发生在遥远的未来，彼时的世界被邪恶的马尔戈力达帝国统治，作为领导者，马尔戈力达四世（松野太纪 配音）组织了一支令人闻风丧胆的拔毛部队，为了掩饰自己寸草不生的头顶，他意在将所有的子民们都变成光头。就

在美丽的阿斯卡岛上，流传着这样一个传说：数千年前，岛民极为害怕红色满月的出现。为了消除恐慌，神赐予岛上的国王盾牌和七星剑，然而当七星剑和红色满月同时出现时，黑暗便会支配整个大地。暂时落脚阿斯卡岛的草帽

某天，草帽海贼团的诸位拾到一个漂流瓶。根据漂流瓶中的信息，在伟大航路上有一个娱乐至上的狂欢岛，靓女、美酒、佳肴应有尽有，是一个海贼中的海贼最值得去的地方。众人几乎未作过多迟疑，扬帆便向狂欢岛挺进。然而

阳光明媚，风平浪静，草帽海贼团的诸位正在享受着快乐时光，而就在此时，娜美却突然发起高烧，一病不起。为了治好她的病，众人扬帆来到拥有“常冬之岛”之称的医疗大国磁鼓王国。在当地人的指点下，路飞等人背着娜美

在天下失序、列强割据的战乱时代，僧人祥庵将一名孤儿从中国带到了日本。孤儿名叫仔太郎，他背负着一个惊人的秘密。与祥庵失散后，孤苦无依的仔太郎带着爱犬飞丸前往赤池之国的万觉寺，在途中遇见了神秘剑士“无名”。仔太郎遭到追杀，危急时刻无名救了他一命。从此两人结伴同行。性格乖僻的浪人和紧闭心扉的少年虽然磕磕碰碰不断，但渐渐成了好朋友。白鸾率领的追杀组织还是抓住了仔太郎，他们开始着手筹备某种仪式。金发碧眼的剑士“罗狼”也是追杀组织中的一员，他虽然听命行事但并不真正在意组织的目的，对他来说，寻找可以与自己匹敌的对手才

沉淀了历史浓厚气息的京都伏见，生活着一个有些鲁莽但十分单纯的女孩伏见稻荷（大空直美配音）。她从小在供奉着狐仙的稻禾神社玩耍，对这里有着深深的羁绊。稻荷偷偷喜欢同班的帅气男孩丹波桥红司（冈本宽志配音），